Artrópodos
Dos investigadores españoles descubren un nuevo código genético en artrópodos 

Madrid. Mayo de 2006 www.infoecologia.com

Infoecologia .-  Los investigadores del Departamento de Biodiversidad y Biología Evolutiva del Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC) Federico Abascal y Rafael Zardoya han participado en un estudio de búsqueda y caracterización de códigos genéticos alternativos en genomas mitocondriales de metazoos. Como resultado han encontrado un nuevo código en artrópodos y han determinado que el código genético ha evolucionado en paralelo en estos organismos, existiendo distintos códigos incluso entre especies de un mismo orden (como en los hemípteros, por ejemplo).

 

Aunque el código genético es idéntico en casi todas las especies (el material genético se traduce al lenguaje de las proteínas de acuerdo a un mismo diccionario), algunas variantes ya se habían descrito en una amplia gama de sistemas, tanto nucleares como en organelos (especialmente en las mitocondrias de los animales) cuando Federico Abascal y Rafael Zardoya comenzaron esta investigación. Las variantes del código genético se suelen encontrar cuando un codón, en una especie X, aparece recurrentemente en lugares de las proteínas donde, en otras especies, aparece un aminoácido distinto al esperado. El significado de ese codón, por tanto, es aquél del aminoácido observado y no el esperado. Para desarrollar esta idea, los investigadores elaboraron un método computacional que automatizara las comparaciones y lo probaron con 626 genomas mitocondriales de metazoos.

 

Los resultados indican que varios artrópodos tienen un nuevo código genético y traducen el codón AGG como lisina, en vez de serina (como en el código genético mitocondrial de invertebrados) o de arginina (como en el código genético estándar). El análisis de la evolución del código genético en los artrópodos revela también que existe una evolución concertada entre el significado del codón AGG y los correspondientes ARN transferentes (ARNt-Ser y ARNt-Lys), los cuales presentan mutaciones puntuales en sus anticodones que explican estos cambios del código. 

 

Como explican los investigadores, las variantes genéticas del código suelen encontrarse por análisis comparativo de secuencias. “Cuando un codón particular aparece en los sitios de la proteína en los que un aminoácido específico se encuentra en otra especie relacionada, la explicación más probable es que se ha reasignado ese codón”. Los investigadores han automatizado este proceso comparativo para aplicarlo a una gran cantidad de genomas.

 

Muchos artrópodos, incluidos los que poseen el nuevo código genético, hacen un uso limitado del codón AGG. Esta escasez hace su asignación particularmente difícil desde un punto de vista estadístico y explica por qué las caracterizaciones anteriores del código genético en estas especies no podían descubrir el nuevo código. Solamente un acercamiento global, que se beneficiara de la comparación de asignaciones a través de múltiples especies, podía determinar la traducción de AGG con alta confianza.

 

Antes de este estudio, cada cambio genético del código en mitocondrias de metazoos se conservaba dentro de un phylum. El estudio demuestra también que las variantes genéticas del código se pueden encontrar entre linajes dentro de un phylum de metazoos. De esta manera, la investigación demuestra que los cambios genéticos del código pueden ser mucho más frecuentes de lo que se creía, y que el gran número de genomas completos secuenciados disponibles actualmente hace que, por primera vez, se pueda elaborar esta cartografía en alta resolución de los cambios del código genético.

 

El número de cambios del código genético en artrópodos (incluidos los cambios dentro de una sola familia de insectos) proporciona un ejemplo sin precedentes de cambios genéticos mitocondriales paralelos, y sugiere que fenómenos similares podrían ser encontrados en otros linajes cuando más secuencias estén disponibles. Los resultados publicados representan un caso extraordinario de múltiples reasignaciones. Puede que las especies de artrópodos con el nuevo código utilicen una interacción codón-anticodón nunca observada antes y en la cuál se produce un apareamiento balanceado en la posición media del codón. Por todas estas razones, el código genético mitocondrial de artrópodos representa un paradigma para futuros estudios sobre la evolución del código genético.

 

 

Federico Abascal es investigador en el Departamento de Biodiversidad y Biología Evolutiva del Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC) y en el Departamento de Bioquímica, Genética e Inmunología de la Universidad de Vigo.

 

Rafael Zardoya  es Investigador Científico en el Departamento de Biodiversidad y Biología Evolutiva del Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC) (http://www.zardoyalab.com)

 

 

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